Les obligations comptables des médecins libéraux 

Exercer en libéral, c’est conjuguer expertise médicale et gestion d’entreprise. Un médecin libéral doit, en plus de ses consultations, assurer le suivi administratif et fiscal de son activité. Contrairement à un salarié, il relève du régime des Bénéfices Non Commerciaux (BNC). 

Les principales obligations comptables et fiscales sont : 

• Tenir une comptabilité de trésorerie : seules les recettes encaissées et les dépenses réellement payées comptent 
• Établir une déclaration 2035 chaque année, avec ses annexes 
• Télétransmettre la 2035 à l’administration fiscale et, éventuellement, à un organisme de gestion agréé (OGA) 
• Payer ses cotisations sociales auprès de l’URSSAF et de la caisse de retraite (CARMF) 
• Reporter ses bénéfices dans la déclaration d’impôt sur le revenu 

Un oubli ou une erreur peut coûter cher. C’est pourquoi l’accompagnement d’un expert-comptable médecin comme TYLS est essentiel. 

Déclaration 2035 : un passage obligé 

La déclaration 2035 regroupe l’ensemble des recettes et des dépenses professionnelles. Elle comprend : 

• Les honoraires encaissés 
• Les rétrocessions d’honoraires 
• Les frais de fonctionnement du cabinet (loyer, charges, assurances) 
• Les frais de véhicule (frais réels ou indemnités kilométriques) 
• Les amortissements (mobilier, matériel médical, informatique) 
• Les cotisations sociales 

Chez TYLS, la production et la télétransmission de la 2035 sont totalement prises en charge. Le médecin reçoit un récapitulatif clair, prêt à reporter sur sa déclaration de revenus personnels. 

Micro-BNC ou régime réel : quel choix pour un médecin libéral ? 

Deux régimes fiscaux sont possibles : 

Le micro-BNC 

• Simplicité administrative 
• Déclaration réduite à une ligne dans la déclaration d’impôt 
• Abattement forfaitaire de 34 % 

👉 Limites : aucune déduction des frais réels, pas d’amortissements. Ce régime convient surtout aux remplaçants avec peu de charges. 

Le régime réel 

• Déclaration 2035 obligatoire 
• Déduction de toutes les charges réelles (cabinet, matériel, véhicule, assurances) 
• Possibilité d’amortir les investissements 

👉 C’est le régime le plus avantageux pour la majorité des médecins libéraux. 

Avec TYLS, vous pouvez utiliser un simulateur fiscal pour comparer les deux régimes et choisir celui qui optimise le mieux votre situation. 

Quels frais un médecin peut-il déduire ? 

Les frais professionnels déductibles en BNC sont nombreux : 

• Frais de cabinet : loyers, électricité, entretien, fournitures 
• Matériel médical et informatique : mobilier, table d’examen, ordinateurs, logiciels 
• Assurances professionnelles : RC Pro, prévoyance, mutuelle 
• Frais de véhicule : frais réels ou indemnités kilométriques 
• Frais de télécommunication : téléphone, internet 
• Cotisations sociales et retraites : URSSAF, CARMF 
• Salaires et charges sociales en cas d’embauche d’un secrétaire médical 
• Forfaits spécifiques médecins (2 %, 3 % et groupe III) : applicables dans certains cas uniquement 

Un comptable médecin libéral comme TYLS identifie tous les frais déductibles et sécurise vos choix fiscaux. 

Les assurances professionnelles des médecins : un poste clé à intégrer dans la comptabilité 

Un médecin libéral doit obligatoirement souscrire certaines assurances pour exercer en toute sécurité. Ces contrats représentent un coût important mais sont intégralement déductibles en comptabilité médicale. 

Les assurances indispensables 

• Responsabilité Civile Professionnelle (RC Pro) : obligatoire, elle couvre les dommages causés aux patients dans le cadre de l’exercice médical 
• Assurance du local professionnel : incendie, dégâts des eaux, vol 
• Assurance véhicule : indispensable pour les visites à domicile 

Les assurances facultatives mais stratégiques 

• Prévoyance : maintien de revenu en cas d’arrêt maladie ou invalidité 
• Complémentaire santé : pour couvrir les soins personnels et ceux de la famille 
• Assurance retraite complémentaire : pour anticiper une pension souvent jugée insuffisante par la CARMF 

👉 Chez TYLS, l’expert-comptable aide à classer et déduire ces frais correctement dans la comptabilité médecin et conseille sur les choix les plus adaptés. 

Pourquoi faire appel à un expert comptable médecin ? 

Un comptable spécialisé pour médecin n’est pas un simple gestionnaire d’écritures. Il joue un rôle clé dans : 

• La conformité : plus de stress lié aux obligations fiscales 
• Le gain de temps : moins d’administratif, plus de temps pour les patients 
• L’optimisation fiscale : arbitrages entre frais réels et forfaitaires, amortissements 
• L’accompagnement stratégique : choix du statut, préparation à la retraite, anticipation des cotisations 
• La sérénité : assistance en cas de contrôle fiscal grâce au Pack Zen 

Chez TYLS, chaque médecin bénéficie d’un expert dédié qui connaît les spécificités médicales. 

Les différences comptables selon les spécialités médicales 

Tous les médecins libéraux ne gèrent pas la même comptabilité. Les obligations de base (2035, cotisations sociales, BNC) restent les mêmes, mais certaines spécialités médicales entraînent des particularités fiscales et comptables. 

• Médecins généralistes : activité régulière, beaucoup de frais liés au cabinet (loyer, matériel courant, secrétariat) 
• Médecins spécialistes (dermatologues, cardiologues, radiologues, etc.) : charges parfois plus lourdes en matériel médical et équipements spécifiques 
• Médecins urgentistes libéraux : nombreux déplacements, frais de véhicule et astreintes particulières 
• Médecins remplaçants : activité plus souple, souvent sous régime micro-BNC si peu de charges, mais nécessitant une organisation rigoureuse pour la facturation et les rétrocessions 
• Cabinets de groupe : gestion plus complexe avec partage de charges, rétrocessions entre confrères, et parfois des salariés 

👉 Chez TYLS, les experts-comptables connaissent les spécificités de chaque spécialité médicale. Ils adaptent la comptabilité et les conseils pour que chaque médecin, qu’il soit généraliste ou spécialiste, optimise ses charges et sécurise sa fiscalité. 

Comptabilité médecin : solutions possibles 

Gérer soi-même sa comptabilité 

• Avantage : coût faible 
• Inconvénients : risque d’erreur, perte de temps, stress lors des déclarations 

Utiliser un logiciel comptabilité médecin 

• Avantage : automatisation partielle, saisie facilitée 
• Inconvénients : absence de conseil personnalisé, aucune assistance en cas de contrôle 

Choisir TYLS, expert-comptable médecin 

• Comptabilité 100 % en ligne et automatisée 
• Déclaration 2035 gérée et télétransmise 
• Outils digitaux + accompagnement humain 
• Tarifs transparents 

👉 TYLS combine le meilleur du digital et de l’expertise humaine. 

Les erreurs fréquentes en comptabilité médicale 

De nombreux médecins libéraux commettent les mêmes erreurs : 

• Confondre dépenses personnelles et professionnelles 
• Reporter la saisie comptable à la fin de l’année 
• Mal calculer les frais de véhicule 
• Oublier certaines charges déductibles 
• Ne pas anticiper ses cotisations sociales 

Un expert-comptable médecin comme TYLS évite ces pièges grâce à un suivi régulier et automatisé. 

Le Pack Zen et l’ECF : sécuriser la comptabilité médicale 

Chez TYLS, deux solutions renforcent la sérénité des médecins libéraux : 

• L’Examen de Conformité Fiscale (ECF) : un contrôle volontaire sur 10 points clés, qui permet de prouver la conformité de votre comptabilité 
• Le Pack Zen : une protection en cas de contrôle fiscal ou social, avec prise en charge des honoraires exceptionnels 

Ces services font la différence et garantissent une tranquillité d’esprit. 

Combien coûte un comptable pour médecin ? 

Le prix varie selon la structure, le volume d’activité et les services choisis. En moyenne : 

• Médecin remplaçant : à partir de 60 €/mois 
• Médecin installé en individuel : 100 à 200 €/mois 
• Cabinet médical avec salariés : 200 à 400 €/mois 

Chez TYLS, les tarifs sont transparents et adaptés aux besoins des médecins, avec des packs personnalisés. 

L’accompagnement TYLS au-delà de la comptabilité 

La mission d’un expert-comptable médecin ne s’arrête pas à la déclaration 2035. Chez TYLS, nous allons plus loin en vous accompagnant sur des sujets stratégiques liés à votre avenir professionnel et personnel : 

• Optimisation de la rémunération : choix entre rémunération directe et arbitrages via la prévoyance ou la retraite complémentaire 
• Préparation à la retraite : calcul des droits acquis, conseils sur la capitalisation individuelle 
• Gestion de patrimoine : conseils fiscaux pour vos investissements personnels (immobilier, épargne) 
• Protection sociale : mise en place de solutions sur mesure pour sécuriser vos revenus en cas d’arrêt d’activité 

👉 Cette vision 360° distingue TYLS d’un simple logiciel comptabilité médecin : nous vous aidons à bâtir une stratégie de long terme. 

FAQ – Comptabilité médecin 

1. Quelles sont mes obligations fiscales en tant que médecin libéral ? 
 Tenir une comptabilité de trésorerie, établir la déclaration 2035, la télétransmettre, payer ses cotisations sociales et déclarer ses revenus. 

2. Dois-je obligatoirement avoir un comptable ? 
 Non, mais c’est fortement recommandé pour éviter erreurs et pénalités. 

3. Quelle est la différence entre micro-BNC et réel ? 
 Le micro est simple mais ne permet pas de déduire les frais réels. Le réel est plus précis et avantageux pour la majorité des médecins. 

4. Quels sont les avantages d’un expert-comptable médecin comme TYLS ? 
 Gain de temps, conformité fiscale, optimisation des charges, accompagnement personnalisé. 

5. Que couvre le Pack Zen ? 
 Une protection en cas de contrôle fiscal ou social, avec prise en charge des honoraires exceptionnels. 

6. Puis-je utiliser un logiciel comptabilité médecin seul ? 
 Oui, mais vous n’aurez ni conseil personnalisé ni assistance en cas de contrôle. 

7. Quels frais puis-je déduire ? 
 Cabinet, matériel médical, véhicule, assurances, téléphonie, cotisations sociales. 

8. TYLS accompagne-t-il aussi les remplaçants ? 
 Oui, des offres spécifiques sont prévues pour eux. 

9. Quel est l’avantage de l’ECF ? 
 Un contrôle volontaire qui renforce la sécurité fiscale et rassure en cas de vérification ultérieure. 

10. Comment choisir un expert-comptable pour médecin ? 
 Privilégiez un cabinet spécialisé dans les professions médicales comme TYLS. 

Conclusion 

La comptabilité médecin est une obligation incontournable pour tous les praticiens libéraux. Entre la déclaration 2035, les frais professionnels, les cotisations sociales et la fiscalité personnelle, les enjeux sont nombreux. 

Avec TYLS, chaque médecin bénéficie d’une solution clé en main : 

• Comptabilité automatisée et conforme 
• Déclaration 2035 prise en charge et télétransmise 
• Pack Zen et ECF pour une sécurité renforcée 
• Un expert dédié aux professions médicales 

👉 Vous soignez vos patients, TYLS s’occupe de votre comptabilité.